基于生物信息学方法预测人线粒体转录终止因子3蛋白的结构与功能

• 作者: 张晓娟 张海洋 徐优 徐彤 杜亚蔓 杨红娟 熊伟
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 人线粒体转录终止因子3 生物信息学 结构 功能
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 367-373
• 页数: 7页
• 分类号: Q811.4|Q518.2
• 字数: 4339字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2015.03.015

摘要

目的:基于生物信息学预测人线粒体转录终止因子3 (hMTERF3)蛋白的结构与功能.方法:利用GenBank、Uniprot、ExPASy、SWISS-PROT数据库资源和不同的生物信息学软件对hMTERF3蛋白进行系统研究,包括hMTERF3的理化性质、跨膜区和信号肽、二级结构功能域、亚细胞定位、蛋白质的功能分类预测、同源蛋白质多重序列比对、系统发育树构建、三级结构同源建模.结果:软件预测hMTERF3蛋白的相对分子质量为47.97× 103,等电点为8.60,不具信号肽和跨膜区;二级结构分析显示主要为螺旋和无规则卷曲,包含6个MTERF基序,三级结构预测结果与二级结构预测结果相符;亚细胞定位分析结果显示该蛋白定位于人线粒体;功能分类预测其为转运和结合蛋白,参与基因转录调控;同源蛋白质多重序列比对和进化分析显示,hMTERF3蛋白与大鼠、小鼠等哺乳动物的MTERF3蛋白具有高度同源性,在系统发育树上聚为一类.结论:hMTERF3蛋白的生物信息学分析为进一步开展对该蛋白的结构和功能的实验研究提供了理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	熊伟	大理大学基础医学院	14	63	5.0	7.0
3	张晓娟		19	78	5.0	8.0
6	张海洋	大理大学基础医学院	8	38	3.0	6.0
7	徐彤	大理大学基础医学院	2	27	2.0	2.0
8	徐优	大理大学基础医学院	1	16	1.0	1.0
9	杨红娟	大理大学基础医学院	1	16	1.0	1.0
10	杜亚蔓	大理大学基础医学院	1	16	1.0	1.0