橡胶树磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因HbPPC1的克隆和表达分析

• 作者: 王岳坤 阳江华
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 橡胶树 磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶 cDNA 生物信息学分析 表达模式
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 895-900
• 页数: 6页
• 分类号: S794.1
• 字数: 4580字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2015.05.012

摘要

根据橡胶树磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)基因的部分序列设计引物,运用RT-PCR和RACE方法获得其家族成员的1个全长cDNA,命名为HbPPC1,长度3 025 bp,包含5'-UTR 34 bp,3'-UTR 93 bp,开放阅读框2 898bp,编码965个氨基酸.预测HbPPC1分子量为110.34 ku,理论等电点为6.09.HbPPC1具有C3型PEPC的结构特征,其N端第9～17位残基是可逆磷酸化的不变序列-X-X-SIDAQLR,C端倒数第4位残基为谷氨酰胺(Q),第774位残基为丙氨酸(A).HbPPC1与5条大戟科植物的PEPC序列(其中木薯2条、蓖麻2条、麻风树1条)的同源性达到95％.系统进化分析表明,HbPPC1与这5条序列聚在同一个进化支中.HbPPC1包含2个酶活性位点和7种类型的Motifs,二级结构以由α-螺旋和无规则卷曲为主.Real-time RT-PCR结果表明,HbPPC1在橡胶树胶乳、叶片、树皮和花中均表达,在胶乳中的表达量最高;胶乳HbPPC1的表达受乙烯利刺激影响,在乙烯利刺激4～72 h后胶乳HbPPC1表达明显下调,表明HbPPC1在胶乳pH值调控中起重要作用.本研究结果为HbPPC1的功能研究提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	阳江华	中国热带农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室	12	78	4.0	8.0
2	王岳坤	中国热带农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室	12	288	5.0	12.0