通过HRM技术筛查与梨矮生性状决定位点PcDw紧密连锁的SNP标记

• 作者: 侯董亮 李炜 王彩虹 田义轲 白牡丹
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 梨 矮生 性状决定位点PcDw SNP标记 HRM
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 果树
• 页码范围: 214-220
• 分类号: S661.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2014-0871

摘要

在果树的基因组中存在大量的SNP(single nucleotide polymorphism)位点,筛查与目标性状紧密连锁的SNP标记,对目标基因的精细定位具有重要意义.以‘矮生梨’(Pyrus communisL.‘Aishengli’)与‘茌梨’(Pyrus bretschneideri Rehd.‘Chili’)的F1杂交分离群体共215个单株为试材,参考苹果基因组的序列设计26对适合HRM分析的引物,依据分离群体分组分析(bulked segregant analysis,BSA)原理,通过高通量熔解曲线(high resolution melting,HRM)分析,筛选到两个与决定梨矮生性状的PcDw基因连锁的标记CNqau012和CNqau039,二者与目标位点的连锁距离分别是13.3 cM和2.3 cM.对CNqau012和CNqau039的扩增子测序分析表明,在矮生型与普通型中都存在一处单核苷酸变化(分别是G/A和C/T).这些标记的获得对PcDw基因的精细定位及克隆具有重要意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	田义轲	青岛农业大学园艺学院	32	282	9.0	15.0
2	王彩虹	青岛农业大学园艺学院	35	285	9.0	15.0
3	白牡丹	青岛农业大学园艺学院	8	53	4.0	7.0
4	李炜	青岛农业大学园艺学院	2	16	1.0	2.0
5	侯董亮	青岛农业大学园艺学院	4	22	2.0	4.0