生物大分子多尺度理论和计算方法?

• 作者: 张建 李文飞 王炜 王骏
• 来源期刊: 物理学报
• 关键词: 生物大分子 多尺度模型 分子模拟 粗粒化
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 所属期刊栏目: 专题：庆祝南京大学物理学科成立100周年
• 页码范围: 098701-1-098701-9
• 页数: 1页
• 语种: 中文
• DOI: 10.7498/aps.64.098701

摘要

分子模拟是研究生物大分子的重要手段。过去二十年来，人们将分子模拟与实验研究相结合，揭示出生物大分子结构和动力学方面的诸多重要性质。传统分子模拟主要采用全原子分子模型或各种粗粒化的分子模型。在实际应用中，传统分子模拟方法通常存在精度或效率瓶颈，一定程度上限制了其应用范围。近年来，多尺度分子模型越来越受到人们的关注。多尺度分子模型基于统计力学原理，将全原子模型和粗粒化模型相耦合，有望克服传统分子模拟方法中的精度/效率瓶颈，进而拓展分子模拟在生物大分子研究中的应用范围。根据模型之间的耦合方式，近年来发展起来的多尺度分子模拟方法可归纳为如下四种类型：混合分辨多尺度模型、并行耦合多尺度模型、单向耦合多尺度模型、以及自学习多尺度模型。本文将对上述四类多尺度模型做简要介绍，并讨论其主要优缺点、应用范围以及进一步发展方向。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王炜	南京大学物理学院固体微结构国家实验室	54	286	9.0	14.0
3	王骏	南京大学物理学院固体微结构国家实验室	14	120	4.0	10.0
5	李文飞	南京大学物理学院固体微结构国家实验室	3	5	1.0	2.0
7	张建	南京大学物理学院固体微结构国家实验室	3	10	2.0	3.0