苎麻肉桂酰辅酶A还原酶基因cDNA序列的克隆与分析

• 作者: 刘芳 唐映红 昌洪涛 袁有美 郭清泉 陈建荣
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 苎麻 肉桂酰辅酶A还原酶基因 木质素 组织表达
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种?种质资源?分子遗传学
• 页码范围: 1324-1332
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2015.01324

摘要

根据苎麻转录组测序信息,利用RACE法克隆出2个肉桂酰辅酶A还原酶基因全长cDNA序列,对其进行生物信息学分析,并利用荧光定量技术对苎麻快速生长期、成熟期和成熟后期该基因在木质部和韧皮部的表达模式进行研究。结果表明,BnCCR1全长1056 bp,编码277个氨基酸, Blast比对BnCCR1基因与白桦、蓖麻CCR基因核苷酸序列相似性均为70%,推测的氨基酸与蓖麻CCR基因氨基酸序列相似度为77%,蛋白质预测显示其N端存在一个3 Beta-HSD/Epimerase/NAD-binding-10的保守域；BnCCR2基因全长1291 bp,编码248个氨基酸, Blast比对BnCCR2基因与毛果杨CCR基因核苷酸序列相似度为74%,推测的氨基酸与蓖麻、毛果杨CCR基因氨基酸序列相似度均为81%,蛋白质预测显示其N端存在一个3 Beta-HSD/Epimerase/NAD-binding-4的保守域；BnCCR1和BnCCR2基因编码蛋白三维模型与矮牵牛 CCR 基因相似度分别达30.68%、44.77%,建模结果可靠；荧光定量结果显示BnCCR1和BnCCR2基因具有时期表达差异性,不具有组织表达差异,但不同组织表达量具有差异。推测BnCCR1和BnCCR2基因是存在于苎麻木质素代谢中的两种CCR基因。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	唐映红	湖南农业大学农学院	7	57	4.0	7.0
2	陈建荣	长沙学院生物与环境工程系	22	104	6.0	9.0
3	刘芳	长沙学院生物与环境工程系	13	132	5.0	11.0
4	袁有美	湖南农业大学农学院	7	48	3.0	6.0
5	郭清泉	长沙学院生物与环境工程系	19	154	8.0	12.0
6	昌洪涛	湖南农业大学农学院	5	19	2.0	4.0