福建省猪流行性腹泻病毒检测与S基因遗传变异分析

• 作者: 吴学敏 吴晓鸣 周伦江 王晨燕 王隆柏 车勇良 陈如敬
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 检测 S基因 变异分析
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 625-630
• 页数: 6页
• 分类号: S858.2
• 字数: 4218字
• 语种: 中文

摘要

为了解猪流行性腹泻（PED ）在福建省的流行和流行毒株S基因的变异情况，对2011－2014年采自117个规模猪场的295份疑似PED的病料进行检测，对14株具有代表性的PEDV毒株进行S基因序列分析。结果显示，2011－2014年病料阳性率分别为87.30％、75.00％、40.91％和34.15％，总阳性率为69.49％，虽然PED阳性率在福建省有下降趋势，但仍较高。基因序列分析表明福建省14株PEDV分离株S基因核苷酸之间的同源性分别为98.5％～100.0％，与国内其他毒株之间的同源性为93.3％～99.5％，其中与国内2009年以前流行的PEDV毒株的同源性较低；与2008年泰国 NPPED2008＿2株的同源性分别为95.8％～96.1％；与CV777标准株的同源性为93.8％～94.1％。分离毒株的S基因片段氨基酸存在多个位点突变、插入和缺失现象。遗传进化树表明14株 PEDV 分离株与2008年泰国 NPPED2008＿2毒株和2009年韩国毒株亲缘关系较近，与attenuated DR13弱毒株及CV777标准株亲缘关系比较远。14株PEDV的S基因序列已登陆Genbank。