河南神仙洞放线菌资源勘探及抗菌活性筛选

• 作者: 刘少伟 姜蓉 孙承航 戴素娟 李小俊 李静 蒋忠科
• 来源期刊: 中国抗生素杂志
• 关键词: 洞穴 放线菌 多样性 生物合成基因簇 生物活性
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 所属期刊栏目: 微生物药物筛选
• 页码范围: 641-648
• 页数: 8页
• 分类号: R978.1
• 语种: 中文

摘要

目的 勘探河南神仙洞放线菌多样性,以期发现药用微生物资源,为新抗生素发现奠定基础.方法 采用10种分离培养基,以稀释涂布法分离放线菌;采用16S rRNA基因序列比对分析开展初步鉴别;经液体发酵,发酵液乙酸乙酯萃取,菌丝体丙酮浸提,获得提取浓缩物样品,采用纸片扩散法对样品进行抗菌活性筛选,活性菌株进行次级代谢产物生物合成基因NRPS,PKS Ⅰ和PKS Ⅱ的筛选.结果 从6份土壤样品中共纯化到179株放线菌;经16S rRNA基因序列比对分析,它们分布于11个科18个属,其中链霉菌属为优势菌属;菌株S6R2A4-9的16S rRNA基因序列与最近有效菌株Flindersiella endophytica EUM 378T的相似率为93.58％,为潜在新属;发酵74株放线菌,其中52株在至少一个抗菌活性筛选中为阳性,总阳性率为70.27％.52株有活性的放线菌中,48株菌存在至少一个次级代谢产物生物合成基因簇,阳性率为92.3％,其中17株同时具有3种生物合成基因簇.结论 河南新密神仙洞土壤中存在较为丰富的药用放线菌资源,具有从中发现放线菌新物种及新抗生素的潜力.