基于RNA-Seq识别山羊肉品质候选基因

• 作者: 付绍印 孟宪然 张文广 李金泉 杜琛 王静 郑竹清
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 绒山羊 背最长肌 肉品质 RNA-Seq 候选基因
• 年，卷（期）: 2015,（8）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 1300-1307
• 页数: 8页
• 分类号: S827.2
• 字数: 5277字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2015.08.004

摘要

通过研究不同年龄和不同性别绒山羊背最长肌之间的差异表达基因,筛选影响绒山羊肉品质的候选基因.本研究基于RNA-Seq技术对4个绒山羊背最长肌的转录组进行高通量测序,在测序评估的基础上,对差异表达基因进行筛选、功能注释和富集分析.本研究通过CLC Genomics Workbench 6.0软件共找到263个候选基因,其中包含123个高表达有利基因和140个高表达有害基因.GO功能注释结果显示,高表达有利基因主要与骨骼肌的生长发育、细胞器的形成和蛋白结合功能有关;高表达有害基因主要与脂质代谢、细胞骨架以及结合功能有关.利用KEGG数据库作为参考,这些基因主要参与糖酵解/糖异生、丝裂原活化蛋白激酶、凝血-补体级联反应和色氨酸代谢等通路中.结合其他家畜基因组学研究,ADIPOQ、PDK4和CD36可能作为参与肉品质重要的候选基因.该结果为绒山羊肉品质的改善以及候选基因的研究提供了理论依据.