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黄瓜棒孢叶斑病菌的分子鉴定及 rDNA-ITS 序列分析
黄瓜棒孢叶斑病菌的分子鉴定及 rDNA-ITS 序列分析
作者:
曹明明
李淑菊
杨瑞环
王惠哲
邓强
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
黄瓜
多主棒孢菌
分子鉴定
rDNA-ITS
摘要:
为了分析不同地区黄瓜棒孢叶斑病菌的种内分化,能够准确地鉴定该病菌,以服务于黄瓜抗病育种,对2007-2014年采集的黄瓜棒孢叶斑病菌多主棒孢经单孢纯化获得34个菌株。利用公开发表的特异性引物CCF/CCR对其进行了PCR分子鉴定,结果表明:34个菌株均扩增得到了预期272 bp的特异片段,说明均为多主棒孢菌。应用真菌核糖体rDNA区通用引物ITS1和ITS4分别扩增各个菌株的rDNA内转录间隔区序列,经测序并比对分析,34个菌株均扩增得到了559 bp的特异片段,其中32个从黄瓜上分离的多主棒孢病菌菌株碱基序列完全一致,2个从番茄上分离的菌株碱基序列完全一致,二者的差异在于2个SNP位点T-C、G-A的突变,二者相似度为99.64%。说明,多主棒孢菌属种间的ITS区序列高度保守,利用ITS序列分析方法可以为多主棒孢菌的分类鉴定及系统发育研究提供依据,可以区分出黄瓜和番茄寄主上的多主棒孢菌。
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文献信息
篇名
黄瓜棒孢叶斑病菌的分子鉴定及 rDNA-ITS 序列分析
来源期刊
华北农学报
学科
农学
关键词
黄瓜
多主棒孢菌
分子鉴定
rDNA-ITS
年,卷(期)
2015,(3)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
175-179
页数
5页
分类号
S642.2|Q78
字数
2922字
语种
中文
DOI
10.7668/hbnxb.2015.03.030
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
杨瑞环
42
146
6.0
9.0
2
李淑菊
69
645
14.0
22.0
3
王惠哲
61
511
12.0
19.0
4
邓强
21
41
4.0
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5
曹明明
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引证文献(1)
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多主棒孢菌
分子鉴定
rDNA-ITS
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
华北农学报
主办单位:
河北
北京
天津
山西
河南
内蒙古六省市农科院农学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-7091
CN:
13-1101/S
开本:
大16开
出版地:
石家庄市和平西路598号
邮发代号:
18-10
创刊时间:
1986
语种:
chi
出版文献量(篇)
6276
总下载数(次)
4
总被引数(次)
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