人Daintain基因5'调控区序列的生物信息学分析

• 作者: 冯秋芳 唐敏 王咸寿 王青松 陈正望 颜冬菁
• 来源期刊: 现代生物医学进展
• 学科: 医学
• 关键词: 人Daintain基因 5'调控区 启动子 CpG岛 转录因子结合位点
• 年，卷（期）: 2015,（21）
• 所属期刊栏目: 生物信息学
• 页码范围: 4178-4181
• 分类号: R34|Q756|Q811.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.13241/j.cnki.pmb.2015.21.050

摘要

目的:探讨人Daintain基因5'调控区的序列特征.方法:利用在线软件BLAST、Neural Network Promoter Prediction、Promoter 2.0、Promoter SCAN、EMBOSS、CpG Island Searcher和TF SEARCH预测人Daintain基因启动子区域、CpG岛分布和转录因子结合位点.结果:人Daintain基因5'调控区存在1个CAAT盒.Daintain基因可能存在6个启动子位点,CpG岛可能位于216 bp区间(23～238 bp).评分85分以上时,该序列存在251个可能的转录因子结合位点;评分90分以上时,该序列存在70个可能的转录因子结合位点;评分95分以上时,该序列存在16个可能的转录因子结合位点;评分100分以上时,该序列存在7个可能的转录因子结合位点;这些结合的转录因子基本是与免疫细胞增殖或性别发生有关.结论:人Daintain基因5'调控区的生物信息学研究表明其转录受甲基化和多种转录因子的调控,为研究Daintain基因启动子的功能提供理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈正望	华中科技大学生命科学与技术学院	44	414	8.0	19.0
2	唐敏	海南医学院理学院生物技术专业实验室	7	18	3.0	4.0
3	王青松	海南医学院理学院生化与分子生物学教研室	15	29	3.0	5.0
4	颜冬菁	海南医学院理学院生化与分子生物学教研室	4	1	1.0	1.0
8	王咸寿	海南医学院理学院生物技术专业实验室	5	14	2.0	3.0
9	冯秋芳	海南医学院理学院生物技术专业实验室	4	14	2.0	3.0