噬菌体Bp7尾丝蛋白gp38密码子用法及偏性分析

• 作者: 任慧英 孙虎芝 张灿
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 噬菌体 Bp7 尾丝蛋白gp38 密码子
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 37-42
• 页数: 6页
• 分类号: Q78|S854.5
• 字数: 3900字
• 语种: 中文

摘要

为了解噬菌体Bp7尾丝蛋白gp38的密码子使用特征,利用生物信息学方法对1株临床分离的多价烈性噬菌体Bp7尾丝蛋白gp38与其他5株T4类噬菌体进行密码子用法的分析比较.结果发现,Bp7尾丝蛋白gp38与其他5株T4类噬菌体密码子的使用模式差别大,Bp7尾丝蛋白gp38偏好于以C结尾的密码子,而其余5株噬菌体偏好A或U结尾;除了AUG (Met)和UGG (Trp)外,还确定了Bp7尾丝蛋白gp38使用的25种高频密码子;通过6株噬菌体gp38的密码子偏性比较发现,Bp7与任何一株噬菌体都存在较大差异;聚类分析的结果也表明,Bp7尾丝蛋白gp38与其余5株噬菌体不属于一类.总体上,噬菌体Bp7尾丝蛋白gp38在密码子使用上比较特殊,gp38基因密码子的分析将为进一步研究噬菌体Bp7的感染机制及扩宽其裂解谱奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	任慧英	青岛农业大学动物科技学院	116	629	14.0	20.0
2	张灿	青岛农业大学动物科技学院	46	118	6.0	9.0
3	孙虎芝	青岛农业大学动物科技学院	8	16	2.0	4.0