基于全基因组重测序的SNP分析在作物基因定位中的研究进展

• 作者: 李俊华 李莎 袁金红 高武军 黄小城
• 来源期刊: 植物生理学报
• 关键词: 全基因组重测序 单核苷酸多态性 基因定位 数量性状位点
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 1400-1404
• 页数: 5页
• 语种: 中文

摘要

在作物重要性状数量性状位点(quantitative trait locus, QTL)定位和突变体研究中,利用传统的遗传标记对目标基因或QTL进行定位,往往工作量大、周期长,难以精确定位。近年来,全基因组重测序(whole genome resequencing, WGR)为从基因组水平开发单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphysim, SNP)标记提供了新的技术条件。利用基于WGR的SNP识别、验证和基因型分析与传统分子标记相结合的方法,能很快挖掘到候选基因和获得导致表型的SNP位点。目前,通过基于WGR的群体驯化和全基因组关联分析以及对杂交后代进行全基因组SNP基因型分析,已经成功定位了若干作物的QTL及突变基因。本文就利用基于WGR的SNP分析方法定位作物重要性状QTL和突变基因的研究概况进行综述,并就该方法在基因/QTL定位上的应用前景进行了探讨和分析。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高武军		81	893	17.0	25.0
2	袁金红		5	12	1.0	3.0
3	李俊华		18	161	7.0	12.0
4	李莎		6	19	3.0	4.0
5	黄小城		1	0	0.0	0.0