鸭Toll样受体3基因克隆及序列分析

• 作者: 刘光清 孟春春 宋凯杰 张淼涛 李丹丹 李传峰 陈宗艳 黄云秀
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 北京鸭 TLR3 分子克隆 序列分析 结构预测
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 22-28
• 页数: 7页
• 分类号: Q78|S858.32
• 字数: 5023字
• 语种: 中文

摘要

为研究鸭Toll样受体3(TLR3)的结构及功能,根据GenBank中已公布的番鸭TLR3(JQ910167.1)基因设计引物,采用RT-PCR从北京鸭外周血单个核细胞中克隆出北京鸭TLR3,命名为duTLR3.利用生物信息学技术预测其结构及功能,研究表明,duTLR3基因开放阅读框为2 688 bp,编码895个氨基酸,富含17.0％亮氨酸;该分子属于Ⅰ型跨膜受体,由胞外区(1-695 aa)、跨膜区(696-718 aa)和胞内区(719-895 aa)3部分组成,N端含有一个信号肽序列,胞外富含18个亮氨酸重复序列(LRR),胞内含有Toll/IL-1R同源区结构域.核苷酸序列同源性分析显示,duTLR3与金定鸭TLR3亲缘关系最接近达到99.6％;与番鸭、鹅、原鸡、斑胸草雀的亲缘关系次之,并同属于禽类分支上;与番鸭、鹅、原鸡、斑胸草雀、人、猕猴、狒狒、小鼠、大鼠、猪、牛、羊、猫亲缘关系渐远;与草鱼和鲤鱼亲缘关系最远.北京鸭体内组织分布结果显示,duTLR3为组成性表达.本研究成功克隆了北京鸭TLR3基因,预测分析并证实了duTLR3具有典型的TLR家族结构特征,为后期探究TLR3如何识别病毒的RNA及引起下游信号级联反应奠定了基础.