基于SRAP标记的国兰种质资源遗传多样性分析及分子身份证构建

• 作者: 吴坤林 唐源江 曹雯静
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 国兰 种质资源 遗传多样性 SRAP标记 分子身份证
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 1795-1806
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2015.09.13

摘要

【目的】探究国兰种质资源遗传多样性水平，并构建分子指纹图谱及分子身份证，为在分子水平上鉴定国兰种质提供技术支撑，也为国兰种质资源开发、保存利用及种质创新奠定基础。【方法】以收集于华南及邻近地区的139份国兰栽培品种和野生种质为材料，采用改良的CTAB法提取基因组DNA，由13条正向引物和16条反向引物随机组成208对SRAP引物，每对引物用品种‘宋梅’和‘大勋’扩增产物进行筛选；PCR扩增产物应用6%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳，电泳胶图进行人工读带，并计算多态性引物的总扩增条带数、多态性条带数和多态性条带比率。按照Botstein公式计算多态信息含量；用POPGENE32软件计算观测等位基因数、有效等位基因数、Nei’s基因多样性指数、Shannon’s信息指数，并进行遗传多样性分析。用NTSYS-pc2.10e软件UPGMA方法进行聚类分析，并计算遗传相似性系数。采用引物对组合的方法，构建139份国兰种质资源数字指纹图谱。【结果】从208对SRAP引物中共筛选出17对多态性好且重复性高的引物，对供试材料进行PCR扩增，共扩增出DNA条带489条，其中多态性谱带484条，多态性比率(PPB)为98.89%，观测等位基因数平均值为2.00，多态性信息含量平均值为0.94，每个位点的有效等位基因数平均值为1.49，Nei’s基因多样多样性指数平均值为0.30，Shannon信息指数平均值为0.45。UPGMA聚类分析表明，139份国兰种质资源的遗传相似系数变化范围为0.51—0.91。在相似系数为0.70时，可划分为6个类群。用SRAP多种引物组合方法可有效区分所有材料，并构建出139份国兰种质资源特异性分子身份证，置信概率达到99.99%。根据聚类结果可以将国兰种质分为4组：一为春兰组，由春兰种质单独构成；二为建墨兰组，主要由建兰和墨兰种质组成；三为寒蕙兰组，主要由寒兰、蕙兰和杂交系组成；四为剑莲兰组，由春剑和莲瓣兰种质组成。而四组之间剑莲兰组与寒蕙兰组亲缘关系最近，与建墨兰组次之，与春兰组亲缘关系较远。【结论】所试国兰种质具有较丰富的遗传多样性水平，基于17对SRAP引物组合所构建的139份国兰种质的分子身份识别体系具有唯一性和高效性，SRAP标记是在分子水平鉴定国兰种质的有效方法之一。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	唐源江	华侨大学花卉工程研究所	24	195	7.0	12.0
2	曹雯静	华侨大学花卉工程研究所	6	57	3.0	6.0