中国黄牛mtDNA16SrRNA基因遗传多样性与系统进化分析

• 作者: 何丹丹 佘一凡 张春雷 房兴堂 武青 陈宏
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 学科: 农学
• 关键词: 中国黄牛 mtDNA 16SrRNA 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2015,（12）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 12-18
• 页数: 7页
• 分类号: S811.5
• 字数: 4583字
• 语种: 中文

摘要

采用PCR和DNA测序技术和生物信息学方法,测定分析了10个中国黄牛品种(群体)和2个外来牛品种共131个体的mtDNA 16S rRNA基因全序列的遗传变异,并分析了品种(群体)间的亲缘关系以及母系起源.结果表明,在12个群体131条16S rRNA基因序列中,共发现了78个变异位点,形成了40种单倍型,揭示了中国黄牛群体具有丰富的遗传多样性.总群体的平均单倍型多样性指数(Hd)为0.857±0.024,平均核苷酸多样性指数(Pi)为0.00582,Kimura双参数品种间遗传距离范围为0.001～0.009,10个中国黄牛品种(群体)核苷酸多样度高于2个外来牛品种.基于Kimura-2-parameter距离采用NJ法构建了10个中国黄牛品种(群体)分子系统树,111个体聚为2簇,即分别与瘤牛和普通牛聚在一起,说明中国黄牛存在两个母系起源,主要起源于瘤牛和普通牛.其中草原红牛和蒙古牛起源于普通牛,恩施牛主要起源于瘤牛,但是对于亲缘关系复杂的中原地区黄牛而言,瘤牛和普通牛对它们的影响力大小因品种而异.这些结果为我国黄牛的种质资源保护、杂交育种和品种改良奠定了分子遗传学基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈宏	江苏师范大学细胞与分子生物学研究所生命科学学院	9	30	3.0	5.0
2	张春雷	江苏师范大学细胞与分子生物学研究所生命科学学院	16	58	3.0	6.0
3	房兴堂	江苏师范大学细胞与分子生物学研究所生命科学学院	29	52	3.0	5.0
4	佘一凡	江苏师范大学细胞与分子生物学研究所生命科学学院	1	3	1.0	1.0
5	武青	江苏师范大学细胞与分子生物学研究所生命科学学院	1	3	1.0	1.0
6	何丹丹	江苏师范大学细胞与分子生物学研究所生命科学学院	1	3	1.0	1.0