青花菜BrERF2基因的RACE克隆与模拟酸雨胁迫下的表达分析

• 作者: 杨碧云 林义章 林俊芳 胡海非 赵瑞丽 钟凤林 高世超
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 青花菜 ERF RACE克隆 生物信息学 表达
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 2093-2102
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2015.11.2093

摘要

为探讨青花菜在模拟酸雨胁迫下ERF基因的表达变化,应用RACE克隆技术,克隆获得青花菜的ERF因的1条cDNA全长序列,命名为BrERF2.应用生物信息学方法,对该基因编码蛋白的氨基酸组成、理化性质、跨膜结构域、信号肽导肽、疏水性/亲水性、二级结构、亚细胞定位、保守结构域等方面进行了预测和分析.结果表明:获得cDNA全长为958 bp,开放阅读框为804 bp,编码267个氨基酸,Real-time PCR结果分析表明模拟酸雨胁迫下BrERF2基因的表达量发生变化,模拟酸雨胁迫初期表达量显著增大,随时间延长,又开始下降,表明其可能参与了青花菜抗酸雨胁迫的应答机制.本研究为青花菜的抗酸雨胁迫研究奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钟凤林	福建农林大学园艺学院	92	414	11.0	14.0
2	林义章	福建农林大学园艺学院	77	941	15.0	27.0
3	赵瑞丽	福建农林大学园艺学院	9	29	4.0	5.0
4	高世超	福建农林大学园艺学院	9	29	4.0	5.0
5	林俊芳	福建农林大学园艺学院	8	39	4.0	6.0
6	杨碧云	福建农林大学园艺学院	14	65	5.0	7.0
7	胡海非	福建农林大学园艺学院	6	51	4.0	6.0