用gyrB、rpoD基因扩增测序进行气单胞菌分类的探讨

• 作者: 李医 贺桃凤 陈晓 陈瑜
• 来源期刊: 临床检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 气单胞菌 基因分类 gyrB rpoD 嗜水气单胞菌 达卡气单胞菌
• 年，卷（期）: 2015,（8）
• 所属期刊栏目: 临床检验技术研究
• 页码范围: 569-572
• 页数: 4页
• 分类号: R446.5
• 字数: 2524字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13602/j.cnki.jcls.2015.08.03

摘要

目的 获得气单胞菌更准确的分类结果.方法 收集经Vitek全自动细菌分析仪及配套的GN鉴定卡鉴定为气单胞菌的菌株231株,对其gyrB、rpoD两个管家基因进行PCR扩增及测序,并与GenBank中标准序列进行基因序列比对和单核苷酸替代率分析,综合分析gyrB、rpoD两基因测序结果并进行基因分类.结果 231株气单胞菌中,69株(29.9％)gyrB和rpoD基因均获得测序结果,86株(37.2％)仅获得gyrB序列,50株(21.6％)仅获得rpoD序列,26株(11.3％)两种基因均未获得序列.生化表型鉴定为嗜水气单胞菌的菌株中62.7％基因分类结果为达卡气单胞菌,仅22.4％为嗜水气单胞菌,其种间生化反应结果相近.结论 气单胞菌属的生化分类与基因分类结果存在差异.达卡气单胞菌与嗜水气单胞菌的鉴定依赖于基因序列分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈瑜	浙江大学医学院附属第一医院检验科	148	1073	15.0	26.0
2	陈晓	浙江大学医学院附属第一医院检验科	46	448	12.0	19.0
3	李医	新疆维吾尔自治区职业病医院检验科	12	60	6.0	7.0
4	贺桃凤	浙江大学医学院	1	3	1.0	1.0