基于辣椒基因组重测序的InDel标记开发及应用

• 作者: 刁卫平 刘金兵 孙茜 戈伟 潘宝贵 王述彬 郭广君 高长洲
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 重测序 InDel标记 种质鉴定
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 1400-1406
• 页数: 7页
• 分类号: S641.3
• 字数: 3540字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2015.06.032

摘要

基于全基因组重测序进行分子标记开发是一种新的方法和趋势。本研究基于辣椒全基因组重测序数据鉴定出的InDel位点，在2号染色体上随机选择并设计了40个InDel标记，以24份辣椒种质验证其有效性。结果显示：40个标记可获得扩增产物，其中具有多态性的标记35个，多态率为87?5％，同时35个标记可以有效地区分24份辣椒种质的多样性和特异性。以上结果表明，基于重测序数据开发辣椒InDel标记切实可行。