基于不同裂解液的蛋白质组样品制备方法的比较研究

• 作者: 刘宁 孙万春 孙宁宁 杨静波 王子健 程欣 高祥
• 来源期刊: 分析化学
• 关键词: 蛋白质组 样品制备 尿素 曲拉通X-100 TRIzol 液相色谱-质谱联用
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 808-813
• 页数: 6页
• 字数: 5237字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11895/j.issn.0253-3820.150076

摘要

蛋白质组学研究所面临的首要问题就是蛋白质组的样品制备,而不同的样品制备方案针对细胞、组织等样品的裂解能力,以及对不同种类蛋白的溶解能力会有很大的差异.本研究以培养的293T细胞为对象,利用质谱分析鉴定蛋白的方法,比较了采用3种常用的蛋白质组样品制备方法(Triton X-100法、尿素法和TRIzol法)所提取蛋白种类的差异,并利用生物信息学工具对所得数据进行了分析.结果表明,Triton X-100法和尿素法所提取蛋白的鉴定数目接近,而TRIzol法所提取蛋白的鉴定数目比二者减少约8％.从所鉴定的蛋白种类来看,3种方法相差较大,仅约有32％的蛋白为3种方法所共有,生物学功能也不尽相同.本研究为评价各种蛋白质组样品制备方法提供了一种快速、有效、全面的研究方法.