基于 SNP 标记技术的糯玉米种质遗传多样性分析

• 作者: 卢柏山 史亚兴 宋伟 徐丽 赵久然
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 糯玉米 SNP标记 遗传多样性 京糯6 白糯6
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 页码范围: 77-82
• 页数: 6页
• 分类号: S513.03
• 字数: 4297字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2015.03.015

摘要

为揭示糯玉米种质的遗传多样性，利用新一代分子标记技术-SNPs（ Single nucleotide polymorphisms ）对39份不同基因型的糯玉米自交系进行了基因型分析。结果表明，1059个SNP标记在39份自交系中的多态性信息含量（PIC）为0．05～0．38，平均含量为0．31；最小等位基因频率（MAF）为0．03～0．50，平均值为0．29；期望杂合度变化范围为0．05～0．50，平均期望杂合度为0．39。39份自交系之间的亲缘关系（Kinship）系数为0．00～0．91，京6与京糯6之间亲缘关系最近。通过Neighbor-joining（ NJ）聚类分析，将39份自交系划分为5大类群，其中系谱来源不清晰的糯玉米自交系均被划分至不同类群中，明确了其亲缘关系。因此， SNP标记适用于糯玉米自交系的遗传多样性分析及亲缘关系研究，可为糯玉米种质资源利用及品种选育提供参考。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵久然	北京市农林科学院玉米研究中心	216	4476	36.0	60.0
2	卢柏山	北京市农林科学院玉米研究中心	32	227	7.0	15.0
3	史亚兴	北京市农林科学院玉米研究中心	29	79	4.0	8.0
4	宋伟	北京市农林科学院玉米研究中心	21	231	7.0	15.0
5	徐丽	北京市农林科学院玉米研究中心	13	33	3.0	5.0