鉴定和预测长非编码RNAs的生物信息学方法

• 作者: 岑益 廖奇 李洋 柳建发 陈思佟
• 来源期刊: 生命科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 长非编码RNAs 鉴定 计算机预测,测序
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 所属期刊栏目: 技术与应用
• 页码范围: 946-952
• 页数: 7页
• 分类号: Q522|Q612
• 语种: 中文
• DOI: 10.13376/j.cbls/2015131

摘要

越来越多的研究表明,长非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs)可以调节蛋白质编码基因的表达、稳定性及亚细胞定位,参与众多重要的生物过程.由于lncRNAs是一类新发现的非编码RNAs,挖掘各物种的IncRNAs仍然是一个值得研究的问题.其中,利用生物信息学方法挖掘和鉴定lncRNAs已经成为当前生物信息学家研究的一个热点.现就基于生物信息学方法对lncRNAs的鉴定研究作一综述,主要内容分为两大类:基于测序和基于特征的计算机预测方法.基于测序又包括EST测序、cDNA测序及二代转录组RNA测序;而基于特征的计算机预测则主要包含基于序列保守性、基于碱基排列顺序及基于表观遗传修饰特征.通过以上几方面的论述,来阐明目前lncRNAs鉴定方法的现状和进展.