泸定百合转录组测序与特性分析

• 作者: 姜福星 杨丽娟 陈其兵 高顺
• 来源期刊: 西北林学院学报
• 关键词: 泸定百合 鳞茎 转录组测序 特性分析
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 林木遗传与培育
• 页码范围: 143-150
• 页数: 8页
• 分类号: Q943
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-7461.2015.05.23

摘要

泸定百合是非常优良的种质基因资源,鳞茎研究是其科研和生产的关键环节,然而泸定百合鳞茎的分子生物学研究尚属空白.为揭示泸定百合鳞茎的分子机制,应用高通量测序技术对泸定百合的鳞茎进行转录组分析.原始数据经过生物信息学分析后,共获得4.9G有效数据,43 412条Unigene;所获得的Unigene与NR,GO,COG和KEGG等数据库进行搜索比对后,发现有30 225条和21 531条Unigene分别获得NR和GO注释,14 069条Unigene得到COG注释,GO注释中获得374条Unigene可能作为转录因子参与泸定百合鳞茎的形成与发育;共有10 822条Unigene参与了KEGG代谢途径,其中有571条Unigene注释到次生代谢合成途径,其中66条和23条Unigene分别参与了萜类和生物碱的合成.研究结果为采用生物技术手段提高百合的药用成分的含量及改善其园艺性状积累了基本资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈其兵	四川农业大学风景园林学院	184	2143	24.0	37.0
2	高顺	四川农业大学生态林业研究所	9	32	3.0	5.0
3	姜福星	四川农业大学园林研究所	12	33	4.0	5.0
4	杨丽娟	四川农业大学园林研究所	11	58	5.0	7.0