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老年患者医院感染的肠外致病性大肠埃希菌毒力因子检测及SNP分析
老年患者医院感染的肠外致病性大肠埃希菌毒力因子检测及SNP分析
作者:
刘双庆
曹阳
陈薇
魏殿军
原文服务方:
天津医药
大肠杆菌
交叉感染
毒力因子类
多态性,单核苷酸
fimH基因
摘要:
目的:了解老年患者医院感染肠外致病性大肠埃希菌(ExPEC)30种毒力因子的检出情况及其分子流行病学特点。方法收集天津地区引起老年患者医院感染的非重复肠外致病性大肠埃希菌140株,采用多重PCR方法检测其毒力因子基因的存在情况,比较不同标本来源ExPEC毒力因子基因的检出率。从检出fimH基因的菌株中选取50株,进行fimH基因的扩增与测序,将全部测序结果与大肠埃希菌对照株CFT037、UTI89和参考株K-12 Gen?Bank数据库中的fimH基因序列均输入软件DNAMAN 6.0.3.93中寻找单核苷酸多态性(SNPs),后将53个fimH基因序列输入软件MEGA4,进行基因分型和树状图的构建。分型结果结合病例回顾,综合分析医院内大肠埃希菌克隆流行情况。结果 ExPEC中毒力因子基因fimH、traT、fyuA、iutA和kpsMT II的检出率较高,非尿标本来源ExPEC的毒力因子基因kpsM II、K5、papC、papEF、papG allele II (Internal)、papA、cnf1(CNF)、sfa/focDE和rfc的检出率均比尿标本来源ExPEC的高。53株菌fimH基因SNPs分析显示,在57个多态位点中发现有60种SNPs。53株菌被分为25个基因型,其中有11组菌株的基因指纹图谱分别完全一致。未发现不同医院的菌株具有相同的基因型。结论老年患者医院感染的肠外致病性大肠埃希菌携带多种毒力因子基因;非尿标本来源的大肠埃希菌可能比尿液标本来源的菌株致病性更强;fimH基因SNPs分型适用于医院大肠埃希菌克隆流行的调查,值得在今后的临床工作中推广。
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肠外致病性大肠埃希菌
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文献信息
篇名
老年患者医院感染的肠外致病性大肠埃希菌毒力因子检测及SNP分析
来源期刊
天津医药
学科
关键词
大肠杆菌
交叉感染
毒力因子类
多态性,单核苷酸
fimH基因
年,卷(期)
2015,(2)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
166-169,170
页数
5页
分类号
R37
字数
语种
中文
DOI
10.11958/j.issn.0253-9896.2015.02.014
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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研究主题发展历程
节点文献
大肠杆菌
交叉感染
毒力因子类
多态性,单核苷酸
fimH基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
天津医药
主办单位:
天津市医学科学技术信息研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
0253-9896
CN:
12-1116/R
开本:
大16开
出版地:
天津市和平区贵州路96号D座《天津医药》编辑部
邮发代号:
创刊时间:
1959-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
9550
总下载数(次)
0
总被引数(次)
34139
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