版纳微型猪近交系PPARD基因克隆及95G/A突变检测

• 作者: 施晨 曾养志 潘伟荣 王淑燕 王配 程霞 陈园园 霍金龙
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 学科: 农学
• 关键词: PPARD 基因克隆 荧光定量PCR 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 13-19
• 页数: 7页
• 分类号: S811.6
• 字数: 4565字
• 语种: 中文

摘要

为深入研究PPARD在猪体内的调节和功能,以版纳微型猪近交系(BMI)为试验动物,通过RT-PCR方法扩增得到PPARD基因全长编码区序列,在编码区第95位检测到A/G两种核苷酸(GenBank登录号:KP757025、KP757026).结果表明,该基因编码462个氨基酸,蛋白分子量为49.74 kD,等电点为7.53.蛋白质结构分析PPARD存在2个保守域,无跨膜结构,不存在信号肽,存在1个亮氨酸富集的核输出信号,其N端、C端均亲水;亚细胞定位显示该蛋白分泌到细胞周质的概率为69.6％.系统进化分析表明猪与牛、犬的亲缘关系较近.利用qPCR检测了PPARD基因mRNA在BMI 14个组织中的表达量,发现在肝脏、耳朵、脾脏、小肠中表达量较高.