广西HIV-1流行株env基因C2V3区序列特征和亚型研究

• 作者: 叶力 梁冰玉 潘沛江 王敏连 王洪 蒋俊俊 赵芳凝 陈荣凤 黄颉刚
• 来源期刊: 中华疾病控制杂志
• 学科: 医学
• 关键词: HIV-1 基因,env 变异(遗传学)
• 年，卷（期）: 2015,（12）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1191-1194
• 分类号: R512.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2015.12.002

摘要

目的 研究广西艾滋病病毒1型流行株的亚型及env基因C2V3区序列变异特征.方法 2009-2012年共收集138份广西HIV-1感染者血浆样本,提取病毒RNA,用巢式聚合酶链反应对env基因C2V3区序列进行扩增,并测序,用MEGA、HyPhy等软件对序列信息进行分析.结果 138份样本中,CRF01 _AE亚型72例;CRF08_BC亚型40例;B亚型13例;CRF07_BC亚型8例;C亚型2例.各亚型基因离散率分别为:CRF01 _AE(0.052±0.053);CRF08_BC (0.044±0.048);CRF07_BC (0.030±0.041);B亚型(0.024±0.044).各亚型之间基因离散率差异无统计学意义(F=1.260,P=0.291).CRF01_AE的负向选择压力比CRF08_BC大(t=10.060,P＜0.001).共发现7种V3环顶端四肽,其中CRF01_AE有6种,CRF08_BC亚型有2种,两者均以GPGQ为主;B(B')亚型有2种,以GPGR为主,CRF07_BC仅出现了1种.在CRF01_AE亚型和B亚型中分别发现了新的V3环顶端四肽GPGM和GTGR.各亚型辅助受体均主要为CCR5.结论 CRF01_AE亚型在广西HIV-1流行株中占优势,其V3环顶端四肽以GPGQ为主.CRF01_AE亚型和B亚型V3环序列出现了新的变异特征.广西HIV-1流行株主要为巨噬细胞嗜性的非合胞体诱导型.