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摘要:
醇溶蛋白是玉米主要的储存蛋白,其中α?醇溶蛋白含量最为丰富,对玉米籽粒品质有重要影响。本研究利用全基因组数据鉴定α?醇溶蛋白基因家族,并从基因保守motif、玉米籽粒不同发育时期基因的表达谱以及转录因子Opaque2对该家族成员表达的影响3个方面分析玉米α?醇溶蛋白基因家族。结果显示,玉米参考基因组中存在39个α?醇溶蛋白基因,其中z1A、z1B、z1C和z1D 4个亚族成员分别为12个、8个、14个和5个。基因保守motif分析发现该家族基因序列高度保守。表达谱分析结果显示该家族表达模式差异较大,其中z1A亚族在籽粒发育时期表达量最高。利用RNA?seq数据剖析在种子发育阶段Opaque 2( O2)野生型和突变体编码该家族成员的表达差异,结果显示O2突变体中z1C亚族成员表达显著下调,z1A亚族表达略有下调,z1B和z1D亚族成员表达量没有显著的变化。本研究在重新注释α?醇溶蛋白家族成员信息的基础上,对该家族的表达谱进行了分析,为今后玉米籽粒品质育种提供了必要遗传信息。
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文献信息
篇名 Opaque2转录因子对玉米α-醇溶蛋白基因家族成员表达的影响
来源期刊 江苏农业学报 学科 农学
关键词 玉米 α-醇溶蛋白 基因家族表达谱 Opaque 2
年,卷(期) 2015,(6) 所属期刊栏目 遗传育种?生理生化
研究方向 页码范围 1224-1231
页数 8页 分类号 S513
字数 5049字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1000-4440.2015.06.006
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研究主题发展历程
节点文献
玉米
α-醇溶蛋白
基因家族表达谱
Opaque 2
研究起点
研究来源
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
江苏农业学报
双月刊
1000-4440
32-1213/S
大16开
南京市孝陵卫钟灵街50号省农科院内
28-113
1985
chi
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