水稻Dof转录因子家族的鉴定与生物信息学分析

• 作者: 华慧 周颖君 杨立明 杨雯 纪剑辉 谢晶
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻 Dof转录因子家族 进化分析
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传育种?生理生化
• 页码范围: 1191-1198
• 页数: 8页
• 分类号: S511.035.3
• 字数: 5973字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2015.06.001

摘要

为了在全基因组水平上鉴定水稻Dof转录因子家族基本生物学特征，本研究对30个水稻Dof转录因子进行了聚类及功能结构域的分析。结合蛋白质氨基酸序列比对结果，明确了该家族所有基因均具有高度保守的Dof结构域；此外，对水稻、拟南芥、二穗短柄草和高粱中Dof家族同源基因的聚类分析表明该家族基因在植物中具有高度同源性。利用MeMe程序进一步分析了水稻Dof转录因子家族的基序特征，结果与聚类分析具有一致性；通过对染色体复制情况的研究，明确了部分Dof基因在水稻本身以及水稻与其他物种之间存在种内和种间的局部染色体复制；结合生物芯片数据，进一步研究了水稻Dof基因在不同组织中的表达，结果显示部分Dof基因在叶片或根、茎部位呈现高表达，部分Dof基因在生殖器官呈现高表达，推测这些Dof基因可能参与这些特定组织的发育。