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芝麻中一个富含脯氨酸新基因的克隆与特征分析
芝麻中一个富含脯氨酸新基因的克隆与特征分析
作者:
吕高强
吴向阳
王心宇
原文服务方:
作物学报
芝麻
青枯雷尔氏菌
富含脯氨酸的蛋白
诱导表达
亚细胞定位
摘要:
芝麻青枯病是影响我国南方芝麻产量及品质的重要病害。该病属细菌病害,由青枯雷尔氏菌引起。本研究利用随机引物对芝麻受青枯雷尔氏菌诱导前后进行基因差异表达分析,发现一个诱导明显下调的基因(片段)。将该片段克隆、测序后,在芝麻基因组数据库中比对其序列,得到一个 ORF 完整的全长基因。序列分析表明该基因无内含子, ORF 长度为1458 bp,编码486氨基酸,其 N 端富含脯氨酸及富含脯氨酸的重复序列,属于富含脯氨酸蛋白(proline-rich protein, PRP),将其命名为 SiPRP (Sesamum indicum proline-rich protein)。根据该基因 ORF 两翼序列设计引物在芝麻 cDNA 中克隆到该基因,测序结果与预测序列一致。Blast 分析表明该基因编码蛋白与其他植物中发现的PRP 蛋白同源性很低,且其富含脯氨酸的重复序列在其他植物中也未发现,推测为一个新型富含脯氨酸蛋白。进一步设计基因专化的定量及半定量 PCR 引物进行其诱导表达分析,再次证明该基因受病菌诱导后下调表达。与其他植物中发现的大多数 PRP 蛋白定位于细胞壁不同, SiPRP 主要定位于细胞膜,少量可以分泌到细胞外。烟草表皮细胞瞬时表达显示该蛋白定位在细胞膜上的特殊结构,推测该蛋白在芝麻和青枯雷尔氏菌的互作中发挥重要作用。
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文献信息
篇名
芝麻中一个富含脯氨酸新基因的克隆与特征分析
来源期刊
作物学报
学科
关键词
芝麻
青枯雷尔氏菌
富含脯氨酸的蛋白
诱导表达
亚细胞定位
年,卷(期)
2015,(12)
所属期刊栏目
作物遗传育种?种质资源?分子遗传学
研究方向
页码范围
1810-1818
页数
9页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3724/SP.J.1006.2015.01810
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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1
王心宇
南京农业大学生命科学学院
8
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吕高强
南京农业大学生命科学学院
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吴向阳
南京农业大学生命科学学院
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研究主题发展历程
节点文献
芝麻
青枯雷尔氏菌
富含脯氨酸的蛋白
诱导表达
亚细胞定位
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
作物学报
主办单位:
中国作物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0496-3490
CN:
11-1809/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1950-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
5614
总下载数(次)
0
总被引数(次)
197718
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