福建省马铃薯纺锤块茎类病毒快速检测及序列分析

• 作者: 刘中华 张鸿 李华伟 李国良 纪荣昌 罗文彬 许泳清 邱思鑫 邱永祥
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 福建省 马铃薯 马铃薯纺锤块茎类病毒 RT-PCR 检测
• 年，卷（期）: 2015,（10）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 984-988
• 页数: 5页
• 分类号: S435.32
• 字数: 3334字
• 语种: 中文

摘要

为检测福建省马铃薯纺锤块茎类病毒及了解其分子变异情况,以感染马铃薯纺锤块茎类病毒的植株为试验材料,提取RNA,反转录cDNA,利用设计合成的特异性引物进行RT-PCR检测,扩增产物经回收纯化后克隆和测序.结果表明,PCR扩增出359 bp的特异片段,将扩增产物经回收和纯化并进行克隆与测序,测序结果经BLAST比对后,该片段为PSTVd基因序列,PSTVd分离物命名为Fujian PTSTd (KM588065.1),与国内外报道的PSTVd分离物同源性达98％以上.该分离物与弱毒株系(M14814.1)、中间株系(AY492084.1)和强毒株系(U23058.1)比对,有11个核苷酸具有多态性,其中5个发生在致病区.不同国家和地区序列进化树分析表明,该分离物与我国北方及欧美国家分离物亲缘关系最近,与新西兰分离物亲缘关系最远.