茄子AP2/ERF转录因子的鉴定及胁迫条件下的表达分析

• 作者: 宇丽 徐小万 李植良 李涛 邵欣欣 黎振兴
• 来源期刊: 植物生理学报
• 关键词: 茄子 AP2/ERF转录因子 生物信息学分析 表达分析 逆境胁迫
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1901-1918
• 页数: 18页
• 语种: 中文

摘要

植物AP2/ERF是一个庞大的转录因子家族,在植物的生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中发挥重要作用。本研究在茄子基因组范围内,利用生物信息学方法对茄子AP2/ERF转录因子家族的成员、分布及结构和功能等进行分析。结果表明,茄子AP2/ERF家族包含130个蛋白质,其中AP2、RAV、ERF亚家族分别含有20、2和108个, ERF分为DREB/CBF (41个成员)和ERF (67个成员)两大亚族,进化分析将二者分为11个小亚族。MEME分析表明其含有20个重要基序,相同亚族中的ERF成员蛋白序列的氨基酸保守域构成相似,且各亚族成员的氨基酸保守域组成类似,表明这些基序的存在对ERF蛋白功能的执行是必需的。利用实时荧光定量PCR对茄子38个ERF基因进行组织表达分析,结果表明其存在组织表达差异；胁迫响应分析结果表明,33个基因受ABA、SA、盐、重金属镉、高温和低温诱导表达,其中部分基因显著上调或下调表达,可能参与茄子逆境胁迫条件下的防御应答反应。本研究结果将为茄子AP2/ERF家族基因的深入研究提供依据,为进一步解析AP2/ERF基因功能奠定基础。