膜果麻黄种子不同发育时期的转录组测序分析

• 作者: 兰倩 刘建锋 史胜青 常二梅 江泽平 邓楠
• 来源期刊: 东北林业大学学报
• 关键词: 膜果麻黄 转录组 芪类 高通量测序
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 页码范围: 28-32
• 页数: 5页
• 分类号: Q522+.6
• 语种: 中文

摘要

以不同萌发期间的膜果麻黄（ E．przewalskii）种子为研究对象，应用新一代高通量测序技术平台Illu-mina HiSeqTM 2000对其进行转录组测序和数据重新组装，结果获得了12999122条初始序列，总长为1169920980 bp，初始序列组装获得序列片段的平均长度与N50值分别为351和548 bp；与COG功能注释、GO分类及KEGG代谢通路分析后，获得了49449个GO功能注释、17751个COG功能注释以及16748个KEGG注释；并从KEGG通路中找到有关芪类、二芳基庚烷和姜醇合成途径的编码基因片段230个。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	江泽平	中国林业科学研究院林业研究所	66	1375	22.0	34.0
2	史胜青	中国林业科学研究院林业研究所	18	289	10.0	17.0
3	刘建锋	中国林业科学研究院林业研究所	39	767	16.0	27.0
4	兰倩	中国林业科学研究院林业研究所	7	50	5.0	7.0
5	常二梅	中国林业科学研究院林业研究所	4	25	3.0	4.0
6	邓楠	中国林业科学研究院林业研究所	4	25	3.0	4.0