猪嵴病毒CH441株VP1基因的克隆与序列分析

• 作者: 兰喜 杨彬 柳纪省 祝俊鹏 马小军
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: VP1 基因 克隆 DNA测序 序列分析
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 页码范围: 72-77
• 页数: 6页
• 分类号: Q78|S828
• 字数: 3955字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2015.02.014

摘要

为了深入研究嵴病毒（swKoV）主要结构蛋白基因 VP1，根据 GenBank中已发表的猪嵴病基因序列设计特异性引物，采用 RT-PCR方法扩增猪嵴病毒 CH441株 VP1基因，并对其进行克隆与测序分析。结果表明，swKoV CH441株的 VP1基因为762 bp，与 GenBank已发表的嵴病毒属的15株嵴病毒序列的 VP1基因相比较，swKoV CH441株的VP1基因与其他各毒株 VP1基因的核苷酸同源性为81.5%~90.2%，氨基酸同源性为86.6%~96.9%，进化分析显示，swKoV CH441株与 GS-1株之间的亲缘关系较近。生物信息学分析显示，VP1蛋白理论等电点（ pI）为4.40，理论分子质量为26.9782 kDa；其序列上共发现18个磷酸化位点，分别为Ser（7）、Thr（6）和Tyr（5），而蛋白的磷酸化与信号转导有关，预测该蛋白为一重要的信号转导分子；无信号肽和跨膜区。为进一步开展 swKoV CH441株 VP1基因在遗传变异等方面的研究奠定了理论基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马小军	甘肃农业大学动物医学院	47	132	6.0	9.0
2	祝俊鹏	甘肃农业大学动物医学院	1	3	1.0	1.0