EXO70基因在甘蓝和白菜基因组中的倍增与趋异进化

• 作者: 卢会翔 吕俊 张毅 张贺翠 施松梅 杨昆 许军红 赵永斌 韩叙
• 来源期刊: 科学通报
• 关键词: EXO70 pfam03081 基因倍增 趋异进化
• 年，卷（期）: 2015,（24）
• 所属期刊栏目: 农学
• 页码范围: 2304-2314
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.1360/N972014-01140

摘要

为探明EXO70基因在白菜和甘蓝基因组中的倍增,从BRAD数据库中分别搜索并鉴定出39和45种不同的EXO70基因.分析发现,同种EXO70及其编码基因在白菜和甘蓝中极度保守,不同类型EXO70的氨基酸组成存在差异,pfam03081是每个EXO70蛋白所共有;不同EXO70基因的外显子数目差异明显,尤以EXO70A的外显子数目最多;BoEXO70在进化过程中发生了较BrEXO70程度更高的DNA丢失情况;白菜和甘蓝EXO70基因总的密码子偏性近乎相同,而不同类EXO70基因之间的密码子使用却出现程度不同的差异.得出推论,尽管EXO70基因在两物种中拥有近乎相同的倍增模式,它在甘蓝中的倍增程度高于白菜;同种类型的EXO70基因在白菜和甘蓝中高度保守,pfam03081是决定EXO70蛋白功能的关键因素;EXO70基因在两个物种内的倍增表现出趋异的进化.