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摘要:
目的 本研究采用转录组测序和生物信息学分析等方法,以期筛选出肺腺癌淋巴结转移相关基因.方法 分别检测伴和不伴纵膈淋巴结转移的EGFR敏感突变肺腺癌临床标本转录组表达谱,筛选出差异表达基因(DEGs);对这些DEGs进行相关生物信息分析,探索这些基因在淋巴结转移进程中可能发挥的作用.q-PCR法验证高表达基因在PC9细胞株(EGFR敏感突变细胞株)中的表达情况.结果 共检测了10例肺腺癌标本的转录组表达谱,通过差异基因表达分析筛选出169个DEGs,其中,68个在肺腺癌样本中表达上调、101个基因表达下调.q-PCR结果显示:高表达基因在PCO细胞中,ZNF572、BRPF3、MMACHC等7个基因的表达量为中丰度,SMOC1、A1BG、BARX1等9个基因为低丰度,其余均为高丰度.结论 TFF3及DUSP6等多个差异表达基因可能涉及肺腺癌纵膈淋巴结转移进程.
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文献信息
篇名 EGFR敏感突变肺腺癌患者纵膈淋巴结转移相关基因的检测与分析
来源期刊 基础医学与临床 学科 医学
关键词 肺腺癌 淋巴结转移 转录组测序 差异表达基因
年,卷(期) 2015,(12) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 1606-1611
页数 6页 分类号 R734.2
字数 2779字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 李梦侠 第三军医大学大坪医院野战外科研究所肿瘤中心 35 195 8.0 12.0
2 兰卫华 第三军医大学大坪医院野战外科研究所泌尿外科 35 228 8.0 14.0
3 张志敏 第三军医大学大坪医院野战外科研究所肿瘤中心 22 116 5.0 10.0
4 李钱 第三军医大学大坪医院野战外科研究所肿瘤中心 4 14 2.0 3.0
5 蓝保华 第三军医大学大坪医院野战外科研究所肿瘤中心 3 13 2.0 3.0
6 何昊 第三军医大学大坪医院野战外科研究所肿瘤中心 3 13 2.0 3.0
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研究主题发展历程
节点文献
肺腺癌
淋巴结转移
转录组测序
差异表达基因
研究起点
研究来源
研究分支
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
基础医学与临床
月刊
1001-6325
11-2652/R
大16开
北京东单三条5号
82-358
1981
chi
出版文献量(篇)
7613
总下载数(次)
10
总被引数(次)
29500
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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