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EGFR敏感突变肺腺癌患者纵膈淋巴结转移相关基因的检测与分析
EGFR敏感突变肺腺癌患者纵膈淋巴结转移相关基因的检测与分析
作者:
何昊
兰卫华
张志敏
李梦侠
李钱
杨镇洲
蓝保华
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
肺腺癌
淋巴结转移
转录组测序
差异表达基因
摘要:
目的 本研究采用转录组测序和生物信息学分析等方法,以期筛选出肺腺癌淋巴结转移相关基因.方法 分别检测伴和不伴纵膈淋巴结转移的EGFR敏感突变肺腺癌临床标本转录组表达谱,筛选出差异表达基因(DEGs);对这些DEGs进行相关生物信息分析,探索这些基因在淋巴结转移进程中可能发挥的作用.q-PCR法验证高表达基因在PC9细胞株(EGFR敏感突变细胞株)中的表达情况.结果 共检测了10例肺腺癌标本的转录组表达谱,通过差异基因表达分析筛选出169个DEGs,其中,68个在肺腺癌样本中表达上调、101个基因表达下调.q-PCR结果显示:高表达基因在PCO细胞中,ZNF572、BRPF3、MMACHC等7个基因的表达量为中丰度,SMOC1、A1BG、BARX1等9个基因为低丰度,其余均为高丰度.结论 TFF3及DUSP6等多个差异表达基因可能涉及肺腺癌纵膈淋巴结转移进程.
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淋巴结转移
浸润深度
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文献信息
篇名
EGFR敏感突变肺腺癌患者纵膈淋巴结转移相关基因的检测与分析
来源期刊
基础医学与临床
学科
医学
关键词
肺腺癌
淋巴结转移
转录组测序
差异表达基因
年,卷(期)
2015,(12)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
1606-1611
页数
6页
分类号
R734.2
字数
2779字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李梦侠
第三军医大学大坪医院野战外科研究所肿瘤中心
35
195
8.0
12.0
2
兰卫华
第三军医大学大坪医院野战外科研究所泌尿外科
35
228
8.0
14.0
3
张志敏
第三军医大学大坪医院野战外科研究所肿瘤中心
22
116
5.0
10.0
4
李钱
第三军医大学大坪医院野战外科研究所肿瘤中心
4
14
2.0
3.0
5
蓝保华
第三军医大学大坪医院野战外科研究所肿瘤中心
3
13
2.0
3.0
6
何昊
第三军医大学大坪医院野战外科研究所肿瘤中心
3
13
2.0
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节点文献
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淋巴结转移
转录组测序
差异表达基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
基础医学与临床
主办单位:
北京生理科学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-6325
CN:
11-2652/R
开本:
大16开
出版地:
北京东单三条5号
邮发代号:
82-358
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
7613
总下载数(次)
10
总被引数(次)
29500
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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