ITS基因测序分析对89株病原真菌鉴定的应用评价

• 作者: 叶大柠 吴尚为 屈平华 张伟铮 张磊 李营 池艳琳 陈东科
• 来源期刊: 临床检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 真菌 内转录间隔区 菌种鉴定
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 所属期刊栏目: 研究生园地
• 页码范围: 860-863
• 页数: 4页
• 分类号: R446.5
• 字数: 3260字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13602/j.cnki.jcls.2015.11.16

摘要

目的 探讨内转录间隔区(ITS)基因扩增测序技术在病原真菌鉴定中应用价值.方法 应用通用引物ITS1和ITS4对收集的89株真菌(包括酵母菌标准菌株6株,室间质评菌7株,临床分离的酵母样真菌42株和丝状真菌34株)进行PCR扩增和基因测序.测序成功的ITS序列在CBS数据库(http://www.cbs.knaw.nl/Collections)进行序列比对,结合Mycobank(http://cn.mycobank.org/)分类信息以获得其菌种鉴定信息.结果 89株不同种类的真菌均成功扩增到ITS靶基因,经测序,89株真菌均获得扩增的全序列.序列比对结果显示,6株酵母菌标准株中,5株鉴定到种,1株鉴定到属;7株室间质评株中,1株酵母菌鉴定到种,6株丝状真菌中2株鉴定到种,1株鉴定到属,3株鉴定到复合群;42株临床分离的酵母样真菌中,39株鉴定到种,3株鉴定到属;34株临床分离的丝状真菌中,10株鉴定到种,18株鉴定到属,6株鉴定为复合群.结论 通用引物ITS1和ITS4广谱性强.ITS基因序列扩增和测序分析可快速、有效鉴定临床疑难真菌,但仍存在数据分析过程烦琐和结果解释困难的问题.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈东科		86	1263	19.0	33.0
2	张伟铮	广东省中医院大学城医院检验科	41	231	9.0	13.0
3	屈平华	广东省中医院大学城医院检验科	43	198	8.0	12.0
4	李营	天津医科大学检验学院	2	9	1.0	2.0
5	叶大柠	广州中医药大学第二临床医学院	2	9	1.0	2.0
6	张磊		12	86	7.0	9.0
7	池艳琳		1	9	1.0	1.0