CODEHOP法设计简并引物克隆鲫鱼肌钙蛋白C(TnC)基因及序列分析

• 作者: 卢玉婷 吉尚雷 张培军 张雅斌 李月红 杜晓燕 王建超
• 来源期刊: 中国兽医杂志
• 关键词: 鲫鱼 简并引物 CODEHOP 肌钙蛋白C(TnC)
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 鱼虾疾病
• 页码范围: 91-93,96
• 页数: 4页
• 分类号: Q789|S917
• 语种: 中文

摘要

本文结合生物信息学资源和生物软件的使用,针对特定的氨基酸序列设计简并引物,利用CODEHOP法设计简并引物克隆鲫鱼肌钙蛋白C(TnC)基因,并构建系统进化树.证明该基因片段与其他鱼类TnC基因具有较高的同源性,其中与斑马鱼同源性最高达到96％,与大西洋鲑、白斑狗鱼、虹鳟、斜带石斑鱼、斑点叉尾鮰的同源性分别为92％、92％、91％、91％、85％.研究表明,应用此种方法设计出的引物简并度相对较低,Tm值的修改较为灵活,产物特异性强.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张雅斌		38	438	11.0	20.0
2	杜晓燕		28	125	6.0	10.0
3	张培军		37	77	4.0	6.0
4	李月红	吉林农业大学动物科学学院	86	353	8.0	16.0
5	卢玉婷	吉林农业大学动物科学学院	13	35	4.0	5.0
6	吉尚雷	吉林农业大学动物科学学院	9	23	3.0	4.0
7	王建超	吉林农业大学动物科学学院	7	11	2.0	2.0