陆地棉GhZIP基因家族全基因组分析

• 作者: 倪万潮 巩元勇 徐珍珍 束红梅 蒋璐 郭书巧
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 棉花 陆地棉基因组 GhZIP基因
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 页码范围: 8-16
• 页数: 9页
• 分类号: S562.03|Q78
• 字数: 4823字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2015.06.002

摘要

ZIP基因家族是生物体内非常重要的一类金属阳离子转运蛋白基因家族,通过对陆地棉基因组的全面分析和鉴定,获得GhZIP基因家族系统性的生物学信息.运用比较基因组学的方法,从陆地棉异源四倍体标准系TM-1基因组数据库中鉴定出45个GhZIP基因,这些基因分布在除了A04、A09、D04和D09号亚基因组以外的22个亚基因组,D亚组比A亚组多5个GhZIP基因,有16对基因在A亚组和相对的D亚组上存在一一对应关系.有44个GhZIP基因具有跨膜结构,其中有36个GhZIP基因的跨膜结构域是6～9个,具有His富集区序列并位于膜内侧可变区的有20个GhZIP基因,只有1个GhZIP基因亚细胞定位不在细胞质膜.对NCBI中陆地棉的EST数据库做比对统计,有21个GhZIP基因没有可匹配的EST序列,其他24个GhZIP基因在棉花的根、茎、叶、花、胚珠、纤维等组织中广泛表达,其中有18个基因在根和/或茎中表达.研究结果为GhZIP基因的克隆和功能研究提供了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	倪万潮	江苏省农业科学院农业部长江下游棉花和油菜重点实验室	92	1506	17.0	36.0
2	郭书巧	江苏省农业科学院农业部长江下游棉花和油菜重点实验室	32	157	7.0	10.0
3	束红梅	江苏省农业科学院农业部长江下游棉花和油菜重点实验室	22	91	5.0	8.0
4	巩元勇	江苏省农业科学院农业部长江下游棉花和油菜重点实验室	17	46	4.0	5.0
5	徐珍珍	江苏省农业科学院农业部长江下游棉花和油菜重点实验室	3	7	2.0	2.0