牛miR-320a的靶基因预测及生物信息学分析

• 作者: 张秀秀 苗向阳 郭云涛
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牛 bta-miR-320a 靶基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 1952-1960
• 页数: 9页
• 分类号: S823|S813.3
• 字数: 6149字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2015.11.006

摘要

旨在对bta-miR-320a的靶基因进行生物信息学预测和分析,探索其影响牛脂肪沉积的作用机制.本试验利用Promoter Scan、TargetScan、DAVID、Cytoscape等生物信息学软件和miRBase、Ensembl、NCBI、miRWalk等数据库对bta-miR-320a进行转录因子结合位点预测、保守性分析、靶基因预测、基因本体论富集分析和信号通路富集分析.结果表明,miR-320(a)在各物种间非常保守,bta-miR-320a启动子区域有SP1等多个转录因子结合位点,获得的84个靶基因主要参与负调控细胞分化、细胞周期、负调控生长等多个生物学过程,涉及p53、细胞周期和MAPK等信号转导通路.由此推测,bta-miR-320a受到SP1等多种转录因子调控,它可能通过对MAPK、细胞周期和p53信号通路中靶基因TP53、MAPK1等的抑制作用调控牛脂肪细胞分化,进而影响了牛的脂肪沉积.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	苗向阳	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	71	407	11.0	16.0
2	张秀秀	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	7	33	3.0	5.0
3	郭云涛	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	5	15	3.0	3.0