草莓轻型黄边病毒北京分离物的CP基因序列分析

• 作者: 冉策 尚巧霞 李永强 杨瑞 邢冬梅 陈柳 陈笑瑜 韩成贵
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 草莓轻型黄边病毒 RT-PCR CP基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 植物保护·农药
• 页码范围: 229-233
• 分类号: S432.4+1
• 语种: 中文

摘要

为了明确引起北京地区草莓病毒病的病毒种类和病毒序列的分子变异特点,从北京地区表现畸形症状的草莓叶片中提取总RNA,利用RT-PCR技术扩增得到草莓轻型黄边病毒(Strawberry mild yellow edgevirus,SMYEV)的含有外壳蛋白(CP)基因的729 nt特异性核苷酸片段.经序列测定和分析可知,北京地区存在2种不同的SMYEV分离物(B J1和BJ2),两者间的核苷酸序列同源性仅为82.72％～82.96％.将北京分离物与分别来自德国、美国、智利、捷克、澳大利亚、比利时、意大利、韩国和中国沈阳等国家或地区的不同分离物的CP基因序列进行分析比较.结果显示,33个分离物可以分为四大组群,BJI和BJ2分别归属不同组群,BJ1与19个其他国家的分离物亲缘关系较近,BJ2与中国沈阳的2个分离物亲缘关系较近.B J1和BJ2与其他分离物的CP基因核苷酸序列同源性分别为81.10％～98.35％和82.03％～98.63％,氨基酸序列同源性介于82.17％～99.17％和90.91％～94.63％.