基于nad5的西施舌漳州群体遗传分化水平分析——以蛤蜊属2个物种差异水平为参照

• 作者: 孟学平 屠海淼 朱笑琳 申欣 程汉良 赵娜娜 阎斌论
• 来源期刊: 生态学报
• 关键词: 西施舌 四角蛤蜊 中国蛤蜊 nad5 差异
• 年，卷（期）: 2015,（8）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 2635-2642
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.5846/stxb201306091547

摘要

扩增了西施舌日照、连云港、北海、漳州4个野生群体、四角蛤蜊和中国蛤蜊各1个群体共73个样本的NAD5基因片段,测序获得了480bp核苷酸序列,分析核苷酸的多态性,旨在评估福建漳州西施舌与日照、连云港、北海西施舌之间的分化水平.结果:从73个序列中共检测到44种单倍型(Hap),其中西施舌4个群体有29种Haps,四角蛤蜊和中国蛤蜊分别有10种和5种Haps,漳州群体与北海、日照、连云港群体单倍型有明显差异;将西施舌分为北海、日照、连云港组(GP1)和漳州组(GP2)2个组,分析核苷酸差异,GP1与GP2间的T、A、G含量差异极显著(P＜0.01).GP1与GP2间的遗传距离与组内(GP1、GP2)遗传距离之比为25.1-41.8,四角蛤蜊与中国蛤蜊之间的遗传距离与种内个体间遗传距离之比为24.4-36.7,GP1、GP2间的差异达到了四角蛤蜊和中国蛤蜊种间差异水平,而日照、北海群体间的遗传距离只有0.009,北海与日照群体地理位置虽远,但遗传差异则很小;AMOVA分析显示漳州西施舌发生了极显著遗传分化(FST=0.966-0.978,P＜0.01).