钦州市钦南区HIV-1流行亚型及gag基因变异特征研究

• 作者: 张达燕 徐鸿庄 沈平 苏齐鉴 蒋丽萍 郭继昌 韦建立 黄毅毅
• 来源期刊: 中国热带医学
• 学科: 医学
• 关键词: 人类免疫缺陷病毒Ⅰ型(HIV-1) 亚型 gag基因 变异 基因离散率
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 1289-1293
• 分类号: R512.91
• 语种: 中文
• DOI: 10.13604/j.cnki.46-1064/r.2015.11.02

摘要

目的 了解钦州市钦南区HIV-1流行亚型及gag基因变异特征.方法 在钦南区采集97名未抗病毒治疗HIV-1感染者的血液样本,从血浆中提取病毒RNA,从单个核细胞中提取前病毒DNA,采用PCR技术对HIV-1 gag基因片段进行扩增并测序.使用MAGA5.03软件对所得序列进行系统进化树分析,并计算gag区及各编码区段的基因离散率.结果 获得72份样本gag基因序列,其中CRF01_AE重组型占72.3％(52/72),CRF07_BC重组型占13.9％(10/72),CRF08_BC重组型占12.5％(9/72),G亚型占1.39％(1/72).CRF01_AE、CRF07_BC和CRF08_BC的gag基因离散率分别为0.049±0.004、0.053±0.005和0.059±0.005,差异具有统计学意义(P＜0.01).结论 钦南区HIV-1主要流行亚型是CRF01_AE,CRF 08_BC亚型离散率大于CRF 01_AE亚型和CRF 07_BC亚型.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	沈平		19	75	5.0	7.0
2	苏齐鉴		33	130	7.0	9.0
3	郭继昌		8	12	2.0	3.0
4	黄毅毅		4	17	2.0	4.0
5	张达燕		2	5	2.0	2.0
6	蒋丽萍		5	24	3.0	4.0
7	徐鸿庄		2	12	2.0	2.0