中国地方猪品种的遗传多样性与聚类分析

• 作者: 何鑫淼 刘娣 吴赛辉 张冬杰 张旭 杨国伟 汪亮 王文涛
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 地方猪 线粒体 遗传多样性 分子进化
• 年，卷（期）: 2015,（10）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 1-4
• 页数: 4页
• 分类号: S828.8
• 字数: 3010字
• 语种: 中文

摘要

我国拥有丰富的地方猪资源,也是世界上家猪驯化较早的中心之一.但近40年,地方猪品种受到国外引进猪种的强烈冲击,在数量和规模上均显著降低,遗传资源受到威胁.本研究利用线粒体基因组序列,对我国21个地方猪品种共计86个个体的遗传多样性进行了分析,并构建了43个地方猪品种的分子进化树.结果表明:中国地方猪线粒体D-Loop区存在序列长度多态性.86个序列共检测到32种单倍型,平均单倍型多样性(Hd)为0.966±0.006,平均核苷酸多样性(Pi)为0.00592±0.00023,遗传多样性贫乏.32种单倍型可明显的聚为2大类,但是单倍型的聚类与地理分布没有显著相关性.分子进化树显示中国地方猪与国外猪种处于2个明显不同的分支上;由于受到人类迁徙活动以及不同猪种间基因交流的影响,猪种的聚类关系与地理分布同样不存在显著相关,很难利用线粒体基因组序列对中国地方猪品种进行准确分类.