基于SSR标记的太湖稻区常规粳稻DNA指纹图谱构建及遗传相似性分析

• 作者: 孙海燕 杨志刚 汤俊 沈宗根 端木银熙 罗兵
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 常规粳稻 DNA指纹构图谱 遗传相似性 太湖地区
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子生物学
• 页码范围: 9-14
• 页数: 6页
• 分类号: S511|S326
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2015.1.9

摘要

[目的]构建太湖稻区粳稻(Oryza sativa L.Subsp.Japonica)DNA指纹图谱,分析粳稻品种间的遗传相似性,为其育种和种子纯度鉴定提供参考.[方法]以19份太湖地区优质常规粳稻品种为材料,利用分布于水稻12条染色体上的24对SSR引物构建其DNA指纹图谱,并分析其遗传相似性.[结果]24对引物在19份粳稻品种中共检测到99个等位基因,每对SSR引物检测到等位基因1～7个,平均为4.1个.筛选获得能完全区分19份粳稻材料的4对核心引物(RM190、RM18、RM297、RM5414),其在19份粳稻中可扩增获得22个多态性片段;以RM190和RM18区分鉴别粳稻材料的能力最强,可以区别鉴定6个粳稻品种,RM297和RM5414仅能鉴别2个粳稻品种,RM297能鉴别常农粳5号和宁9103,RM5414能区分南粳47和常粳10-9.19份粳稻品种间的遗传相似系数变幅为0.408～0.857,平均为0.605,遗传相似系数在0.500～0.700的材料占81.87％.UPGMA聚类分析结果显示,在遗传相似系数0.550处,19份粳稻材料可聚为两大类群;在遗传相似系数0.620和0.570处,两大类群均可分为两个亚群.[结论]太湖地区常规粳稻品种遗传背景相似度高,遗传多样性不够丰富,有待进一步加强引进和利用新的基因资源,创新水稻育种材料.