柑橘CjGH3.4和CjGH3.7基因的生物信息学分析及表达分析

• 作者: 何绍兰 吕强 庞少萍 易时来 谢让金 邓烈 郑永强 钱春 马岩岩
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 柑橘 植物激素 逆境 GH3 基因表达
• 年，卷（期）: 2015,（12）
• 所属期刊栏目: 果树
• 页码范围: 2362-2372
• 分类号: S666
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0589

摘要

以资阳香橙(Citrusjunos Sieb.ex Tanaka)为材料,基于柑橘全基因组对两个生长素酰胺合成酶基因GH3 (Gretchen Hagen 3),即CjGH3.4和CjGH3.7进行生物信息学分析及表达分析.结果表明:CjGH3.4的开放阅读框(ORF)长度为1 830 bp,编码609个氨基酸;CjGH3.7的ORF为1 800 bp,编码599个氨基酸.基因结构分析显示CjGH3.4含有两个内含子,CjGH3.7含有3个内含予.通过比对发现,这两个基因编码的蛋白序列与拟南芥、水稻、大豆、杨树等具有的较高的同源性,相似度可达66％～81％.CjGH3.7主要在叶组织中表达,CjGH3.4在根和叶组织中表达均较高,且叶高于根.在根和叶组织中,CjGH3.4和CjGH3.7均受低温、高盐以及PEG胁迫诱导,表明其参与了柑橘逆境响应过程.CjGH3.4和CjGH3.7在叶中受到ABA、ACC、MeJA和SA等诱导,在根中却受到抑制,呈现相反的表达模式.