德保矮马X染色体选择信号筛选

• 作者: 何晓红 刘雪雪 浦亚斌 潘建飞 王月月 董坤哲 蒋琳 阿地力江·卡德尔 马月辉
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 德保矮马 FST XP-EHH X染色体 选择信号
• 年，卷（期）: 2015,（12）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 2161-2168
• 页数: 8页
• 分类号: S821|S821.21
• 字数: 5239字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2015.12.006

摘要

旨在对德保矮马(Debao pony)X染色体的选择信号进行筛选.本研究利用Illumina公司开发的马芯片Equine 65K SNP BeadChip,对德保矮马、伊犁马、蒙古马进行X染色体扫描,获得2 339个SNPs位点.通过群体分化系数FsT法和XP-EHH两种不同的方法,分别以伊犁马和蒙古马为对照群体对德保矮马进行X染色体选择信号检测.结果,筛选到两个受到较强选择区域4.0～39.9和87.1～123.5 Mb,包含64个“离群位点”.通过基因注释筛选到PHEX、BCOR、PNPLA4和GPC3等与生长和骨骼发育相关的基因.研究结果发现,德保矮马的选育过程中X染色体很多与生长相关的基因受到了强烈的选择,其中部分在马中未见报道,可以作为研究矮小性状的重要候选基因.