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摘要:
目的 对西洋参Panax quinquefolium种子休眠与萌发过程中赤霉素20-氧化酶(GA20ox)基因编码区进行克隆及生物信息学分析.方法 根据西洋参种子转录组的注释信息,得到9条GA20ox相关序列,通过比对分析确定了GA20ox的转录本.采用qRT-PCR方法得到西洋参GA20ox (PqGA20ox)的cDNA全长,并对其编码蛋白进行生物信息学分析.采用实时荧光定量PCR方法检测PqGA20ox基因在根、茎、叶和种子休眠不同时期的表达水平.结果 生物信息学分析表明,PqGA20ox基因全长1 092 bp,编码363个氨基酸残基,PqGA20ox编码蛋白不含跨膜区,不含信号肽.qRT-PCR实验结果显示PqGA20ox基因在形态休眠起始期和生理休眠起始期表达量高于其他时期.结论 首次获得PqGA20ox基因的编码区序列,为进一步研究西洋参种子解除休眠的分子机制奠定基础.
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文献信息
篇名 西洋参赤霉素20-氧化酶基因的克隆与序列分析
来源期刊 中草药 学科 医学
关键词 西洋参 种子休眠与萌发 赤霉素20-氧化酶 克隆 实时荧光定量PCR
年,卷(期) 2015,(11) 所属期刊栏目 药材与资源
研究方向 页码范围 1656-1660
页数 分类号 R282.12
字数 语种 中文
DOI 10.7501/j.issn.0253-2670.2015.11.018
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 祁建军 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所 59 458 12.0 19.0
2 李先恩 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所 110 1048 17.0 27.0
3 孙鹏 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所 30 233 9.0 14.0
4 廖登群 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所 9 39 4.0 6.0
5 孙同玉 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所 3 26 3.0 3.0
6 祝娟 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所 2 8 2.0 2.0
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研究主题发展历程
节点文献
西洋参
种子休眠与萌发
赤霉素20-氧化酶
克隆
实时荧光定量PCR
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
中草药
半月刊
0253-2670
12-1108/R
大16开
天津市南开区鞍山西道308号
6-77
1970
chi
出版文献量(篇)
14898
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32
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