教酒链霉菌NRRL 3882中钙霉素生物合成后修饰基因calD的功能分析

• 作者: 吴秋林 李园莉 梁晶丹 汪志军 苟丽霞 邓子新
• 来源期刊: 微生物学通报
• 关键词: 教酒链霉菌NRRL 3882 钙霉素 calD基因 3-Hydroxylcezomycin
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 药物微生物
• 页码范围: 148-156
• 语种: 中文
• DOI: 10.13344/j.microbiol.china.140300

摘要

[目的]钙霉素是二价阳离子载体,是一类含有吡咯环的聚醚类抗生素,广泛用于细胞二价阳离子的生物学功能研究.本文以钙霉素生物合成基因簇中calD基因为研究对象,通过蛋白质同源序列比对、基因敲除、回补验证及HPLC/MS分析,对calD基因的功能进行表征.[方法]对calD基因功能进行生物信息学预测.选用钙霉素产生菌Streptomyces chartreusis NRRL3882,通过PCR-targeting的方法对calD基因进行敲除获得突变株,再将calD基因克隆到链霉菌整合质粒上,通过接合转移技术将calD回补到缺失株中.使用HPLC/MS技术对菌株发酵产物进行分析.[结果]生物信息学预测CalD蛋白酶属于氧化还原酶.获得calD基因敲除突变株⊿calD及基因回补菌株⊿calD:calD. HPLC/MS检测到calD基因的缺失菌株大幅降低钙霉素产生能力,与野生型菌株相比,突变株中积累更多的3-Hydroxylcezomycin和更少的氮-去甲基钙霉素.[结论]calD参与钙霉素的生物合成.calD的缺失导致3-Hydroxylcezomycin的积累,推测calD负责钙霉素生物合成途径中苯并噁唑环3位上羟基转化成酮基的氧化反应.初步阐明了calD基因在钙霉素生物合成途径中的功能机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邓子新	上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室	50	323	8.0	17.0
2	汪志军	上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室	9	18	3.0	3.0
3	吴秋林	上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室	2	11	1.0	2.0
4	梁晶丹	上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室	5	9	2.0	2.0
5	李园莉	上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室	1	1	1.0	1.0
6	苟丽霞	上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室	1	1	1.0	1.0