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人源α-烯醇化酶B细胞表位鉴定及其与牙龈卟啉单胞菌烯醇化酶的交叉反应预测
人源α-烯醇化酶B细胞表位鉴定及其与牙龈卟啉单胞菌烯醇化酶的交叉反应预测
作者:
揭瑞
杜戎
王瑞玲
耿辉
董佳慧
韩冬
韩魏巍
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
抗原表位
人源α-烯醇化酶
牙龈卟啉单胞菌烯醇化酶
交叉反应
摘要:
目的:预测鉴定人源α-烯醇化酶蛋白的B细胞抗原表位,探讨人源α-烯醇化酶与牙龈卟啉单胞菌烯醇化酶之间的交叉反应性。方法:以人源α-烯醇化酶蛋白序列为基础,综合应用多个软件预测B细胞线性表位;再以人源α-烯醇化酶的蛋白晶体结构为基础,采用4个生物信息学软件综合预测B细胞构象表位;利用原核表达系统对人源α-烯醇化酶蛋白进行表达、亲和层析法进行,纯化抗原免疫BALB/c小鼠,化学合成预测的线性表位片段检测抗体反应,确定人源α-烯醇化酶蛋白B细胞表位。利用ClustalX进行蛋白质序列比对和Swiss-Model进行同源模建,研究人源α-烯醇化酶和牙龈卟啉单胞菌烯醇化酶的交叉反应性。结果:人源α-烯醇化酶线性B细胞表位优势区域为9-25aa,28-43aa,70-85aa,163-178aa,229-244aa,280-295aa;构象性B细胞表位优势区域为:1-4/24-30/77-86/124aa,9-16/51-59aa,250-254/262-268/271-274aa;合成的线性表位片段中9-25aa免疫应答反应最强烈,其次是70-85aa ,再次为28-43aa,163-178aa,229-244aa,280-295aa;牙龈卟啉单胞菌烯醇化酶和人源α-烯醇化酶氨基酸序列同源性高达50.11%,两者在线性B细胞表位优势区域的9-24aa和32-42aa序列高度相似;空间构象比对结果显示牙龈卟啉单胞菌烯醇化酶和人源α-烯醇化酶之间的RMSD值为1.055?,且两者在3个构象性B细胞表位优势区域的空间构象高度相似,推测二者可能在上述区域发生交叉反应。结论:预测并鉴定了人源α-烯醇化酶蛋白的B细胞抗原表位,比较其与牙龈卟啉单胞菌的烯醇化酶可能发生交叉反应的位点,为研究人源α-烯醇化酶蛋白的自身抗原性和类风湿性关节炎发病机制提供了理论基础。
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篇名
人源α-烯醇化酶B细胞表位鉴定及其与牙龈卟啉单胞菌烯醇化酶的交叉反应预测
来源期刊
中国免疫学杂志
学科
医学
关键词
抗原表位
人源α-烯醇化酶
牙龈卟啉单胞菌烯醇化酶
交叉反应
年,卷(期)
2015,(1)
所属期刊栏目
生物治疗
研究方向
页码范围
66-72
页数
7页
分类号
R392.11
字数
5665字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1000-484X.2015.01.014
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(35)
共引文献
(22)
参考文献
(23)
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节点文献
抗原表位
人源α-烯醇化酶
牙龈卟啉单胞菌烯醇化酶
交叉反应
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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中国免疫学杂志
主办单位:
中国免疫学会
吉林省医学期刊社
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-484X
CN:
22-1126/R
开本:
大16开
出版地:
长春市建政路971号
邮发代号:
12-89
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
7702
总下载数(次)
13
总被引数(次)
40225
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英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
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