深圳地区疱疹性咽峡炎疫情的柯萨奇病毒A4型VP1区基因特征分析

• 作者: 何雅青 卓菲 姚相杰 杨贵清 蔡春林
• 来源期刊: 中华医学杂志
• 关键词: 柯萨奇病毒A组4型 疱疹性咽峡炎 VP1区 基因型
• 年，卷（期）: 2015,（16）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 1226-1229
• 页数: 4页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0376-2491.2015.16.009

摘要

目的 分析从2012年和2014年深圳市2起疱疹性咽峡炎疫情中获得的6株柯萨奇病毒A组4型(CVA4)的VP1区遗传进化特征.方法 采用荧光定量反转录(RT)-PCR法对疱疹性咽峡炎患儿咽拭子标本进行总肠道病毒(EV)、人肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CVA16)、CVA4、CVA6和CVA10进行检测,对CVA4阳性样本采用RT-PCR方法扩增其VP1区全长序列,并进行核苷酸序列测定和系统进化分析.结果 在2起疫情中共鉴定出6株CVA4病毒,均为GIb基因亚型.其中的2014年深圳CVA4病毒株与2012年深圳CVA4病毒株核苷酸的同源性仅为94.1％(变异率达5.9％);氨基酸的同源性为98.3％,共发现5个氨基酸突变aa22N-S、aa34T-A、aa63N-S、aa165A-D、aa200T-A.进化分析表明,2012年深圳CVA4病毒株与山东省KF150144株进化关系最近;而2014年深圳CVA4病毒株与吉林省JQ715709株的进化关系最近.结论 2014年深圳CVA4病毒株和2012年病毒株的VP1区存在较大的核苷酸变异,基因内部走势明显不同.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	卓菲	深圳市罗湖区疾病预防控制中心微生物检验科	47	212	7.0	10.0
2	何雅青	深圳市疾病预防控制中心重大传染病监控实验室	53	626	13.0	23.0
3	蔡春林	深圳市罗湖区疾病预防控制中心微生物检验科	12	68	6.0	8.0
4	姚相杰	深圳市疾病预防控制中心重大传染病监控实验室	29	244	8.0	14.0
5	杨贵清	深圳市罗湖区疾病预防控制中心微生物检验科	19	84	6.0	7.0