枯草芽孢杆菌代谢组样品前处理方法的比较研究

• 作者: 杨泓喆 杨霁菡 王永帅 王洪彬 路福平
• 来源期刊: 分析化学
• 关键词: 代谢组学 枯草芽孢杆菌 气相色谱-质谱联用 前处理
• 年，卷（期）: 2015,（8）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1169-1174
• 页数: 6页
• 字数: 4950字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11895/j.issn.0253-3820.150087

摘要

本研究比较了不同淬灭剂(甲醇、60％甲醇、60％甲醇-0.9％ NaCl、60％甲醇-0.9％(NH4)2CO3和60％甲醇-0.9％ NaAc)条件下胞内物质核酸、蛋白质和代谢物的渗漏情况,发现60％甲醇-0.9％(NH4) 2CO3和60％甲醇-0.9％ NaAc渗漏最少;比较了珠磨法、液氮研磨法、超声破碎3种细胞破碎方法条件下代谢物的提取效果,发现珠磨法提取效果最佳;比较了不同衍生时间(0.5～2.5 h)下代谢物相对丰度的变化,发现衍生时间达到2.0h后,代谢物丰度不再有显著变化.最终确定了枯草芽孢杆菌代谢组样品最适前处理方法:预冷的60％甲醇-0.9％ (NH4)2CO3淬灭,珠磨法破碎细胞,细胞破碎物用O-Bis[三甲基硅烷]三氟乙酸盐(MSTFA)衍生2h.采用本方法从枯草芽孢杆菌中共鉴定到223种代谢物,包括大量氨基酸、有机酸和糖类物质.本研究为枯草芽孢杆菌的代谢组学研究提供了基础.